Reiseleistungen unterliegen der besonderen Regelung der Margenbesteuerung gemäß § 25 UStG. Diese findet infolge eines Vertragsverletzungsverfahrens gegen Deutschland auch im B2B-Geschäft Anwendung. Zudem kann die Marge nicht mehr wie bisher global ermittelt werden, sondern ist für jede einzelne Reise gesondert zu berechnen..

Während die Margensteuer im B2C-Geschäft, wo die Umsatzsteuer planmäßig Preisbestandteil ist und für den Endverbraucher zum Kostenfaktor wird, ihre Stärken ausspielt, hat sie im B2B-Bereich den gravierenden Nachteil des Vorsteuerabzugsverbots. Dadurch verteuert sich das geschäftliche Reisen. Mit der Regelung verbunden sind zahlreiche Folgefragen, etwa zur Abgrenzung der Reiseleistung von anderen regelbesteuerten Leistungen und der „Infektion“ von Nichtreiseleistungen durch die Margensteuer, insbesondere im MICE-Geschäft (Meetings, Incentives, Conferences, Exhibitions). Zu beachten sind darüber hinaus die Rückausnahmen und die damit verbundene Möglichkeit, die Anwendung der Margensteuer zu vermeiden. Infolge einer nach wie vor fehlenden Harmonisierung des Anwendungsbereichs der Spezialregelungen innerhalb der EU gibt es nicht zuletzt im grenzüberschreitenden Geschäft große Herausforderungen.